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caenorhabditis
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The Canadian VirusSeq Data Portal & Duotang: open resources for SARS-CoV-2 viral sequences and genomic epidemiology
보고서
Author
Gill, Erin E.
Jia, Baofeng
Murall, Carmen Lia
Poujol, Raphaël
Anwar, Muhammad Zohaib
John, Nithu Sara
Richardsson, Justin
Hobb, Ashley
Olabode, Abayomi S.
Lepsa, Alexandru
Duggan, Ana T.
Tyler, Andrea D.
N'Guessan, Arnaud
Kachru, Atul
Chan, Brandon
Yoshida, Catherine
Yung, Christina K.
Bujold, David
Andric, Dusan
Su, Edmund
Griffiths, Emma J.
Van Domselaar, Gary
Jolly, Gordon W.
Ward, Heather K. E.
Feher, Henrich
Baker, Jared
Simpson, Jared T.
Uddin, Jaser
Ragoussis, Jiannis
Eubank, Jon
Fritz, Jörg H.
Gálvez, José Héctor
Fang, Karen
Cullion, Kim
Rivera, Leonardo
Xiang, Linda
Croxen, Matthew A.
Shiell, Mitchell
Prystajecky, Natalie
Quirion, Pierre-Olivier
Bajari, Rosita
Rich, Samantha
Mubareka, Samira
Moreira, Sandrine
Cain, Scott
Sutcliffe, Steven G.
Kraemer, Susanne A.
Joly, Yann
Alturmessov, Yelizar
consortium, CPHLN
consortium, CanCOGeN
Academic, VirusSeq Data Portal
network, Health
Fiume, Marc
Snutch, Terrance P.
Bell, Cindy
Lopez-Correa, Catalina
Hussin, Julie G.
Joy, Jeffrey B.
Colijn, Caroline
Gordon, Paul M. K.
Hsiao, William W. L.
Poon, Art F. Y.
Knox, Natalie C.
Courtot, Mélanie
Stein
,
Lincoln
Otto, Sarah P.
Bourque, Guillaume
Shapiro, B. Jesse
Brinkman, Fiona S. L.
DB Label
Database : arXiv
원문보기
Open Access (Arxiv)
2
Oncogenic ETS fusions promote DNA damage and proinflammatory responses via pericentromeric RNAs in extracellular vesicles.
학술저널
issue
The Journal of Clinical Investigation
. 134(9)
Author
Ruzanov, Peter
Evdokimova, Valentina
Pachva, Manideep
Minkovich, Alon
Zhang, Zhenbo
Langman, Sofya
Gassmann, Hendrik
Thiel, Uwe
Orlic-Milacic, Marija
Zaidi, Syed
Peltekova, Vanya
Heisler, Lawrence
Sharma, Manju
Cox, Michael
McKee, Trevor
Zaidi, Mark
Lapouble, Eve
Delattre, Olivier
Radvanyi, Laszlo
Burdach, Stefan
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Sorensen, Poul
Mcpherson, John
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Open Access (eScholarship)
3
JBrowse 2: a modular genome browser with views of synteny and structural variation
학술저널
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Genome Biology
. 24(1)
Author
Diesh, Colin
Stevens, Garrett J
Xie, Peter
De Jesus Martinez, Teresa
Hershberg, Elliot A
Leung, Angel
Guo, Emma
Dider, Shihab
Zhang, Junjun
Bridge, Caroline
Hogue, Gregory
Duncan, Andrew
Morgan, Matthew
Flores, Tia
Bimber, Benjamin N
Haw, Robin
Cain, Scott
Buels, Robert M
Stein
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Lincoln
D
Holmes, Ian H
DB Label
Database : eScholarship
원문보기
Open Access (eScholarship)
4
WormBase in 2022—data, processes, and tools for analyzing Caenorhabditis elegans
학술저널
issue
Genetics
. 220(4)
Author
Davis, Paul
Zarowiecki, Magdalena
Arnaboldi, Valerio
Becerra, Andrés
Cain, Scott
Chan, Juancarlos
Chen, Wen J
Cho, Jaehyoung
da Veiga Beltrame, Eduardo
Diamantakis, Stavros
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Grigoriadis, Dionysis
Grove, Christian A
Harris, Todd W
Kishore, Ranjana
Le, Tuan
Lee, Raymond YN
Luypaert, Manuel
Müller, Hans-Michael
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Nuin, Paulo
Paulini, Michael
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Russell, Matthew
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Singh, Archana
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Williams, Gary
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Howe, Kevin L
Schedl, Tim
Stein
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Lincoln
Sternberg, Paul W
DB Label
Database : eScholarship
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5
The transcriptional landscape of Shh medulloblastoma.
학술저널
issue
Nature communications
. 12(1)
Author
Skowron, Patryk
Farooq, Hamza
Cavalli, Florence MG
Morrissy, A Sorana
Ly, Michelle
Hendrikse, Liam D
Wang, Evan Y
Djambazian, Haig
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Mungall, Karen L
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Dai, Shizhong
Stucklin, Ana S Guerreiro
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Holgado, Borja L
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Wu, Xiaochong
Abd-Rabbo, Diala
Bérubé, Pierre
Wang, Yu Chang
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Suarez, Raul A
Rastan, Avesta
Gillmor, Aaron H
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Zhang, Xiao Yun
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Dirks, Peter
Malkin, David
Bouffet, Eric
Tabori, Uri
Loukides, James
Doz, François P
Bourdeaut, Franck
Delattre, Olivier O
Masliah-Planchon, Julien
Ayrault, Olivier
Kim, Seung-Ki
Meyronet, David
Grajkowska, Wieslawa A
Carlotti, Carlos G
de Torres, Carmen
Mora, Jaume
Eberhart, Charles G
Van Meir, Erwin G
Kumabe, Toshihiro
French, Pim J
Kros, Johan M
Jabado, Nada
Lach, Boleslaw
Pollack, Ian F
Hamilton, Ronald L
Rao, Amulya A Nageswara
Giannini, Caterina
Olson, James M
Bognár, László
Klekner, Almos
Zitterbart, Karel
Phillips, Joanna J
Thompson, Reid C
Cooper, Michael K
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Liau, Linda M
Garami, Miklós
Hauser, Peter
Li, Kay Ka Wai
Ng, Ho-Keung
Poon, Wai Sang
Yancey Gillespie, G
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McLendon, Roger E
Thompson, Eric M
Zagzag, David
Vibhakar, Rajeev
Ra, Young Shin
Garre, Maria Luisa
Schüller, Ulrich
Shofuda, Tomoko
Faria, Claudia C
López-Aguilar, Enrique
Zadeh, Gelareh
Hui, Chi-Chung
Ramaswamy, Vijay
Bailey, Swneke D
Jones, Steven J
Mungall, Andrew J
Moore, Richard A
Calarco, John A
Stein
,
Lincoln
D
Bader, Gary D
Reimand, Jüri
Ragoussis, Jiannis
Weiss, William A
Marra, Marco A
Suzuki, Hiromichi
Taylor, Michael D
DB Label
Database : eScholarship
원문보기
Open Access (eScholarship)
6
Pathway-based, reaction-specific annotation of disease variants for elucidation of molecular phenotypes
학술저널
issue
DATABASE-THE JOURNAL OF BIOLOGICAL DATABASES AND CURATION
; MAY 7 2024, 2024 pbaae031 14p.
Author
Orlic-Milacic, Marija
Rothfels, Karen
Matthews, Lisa
Wright, Adam
Jassal, Bijay
Shamovsky, Veronica
Trinh, Quang
Gillespie, Marc E.
Sevilla, Cristoffer
Tiwari, Krishna
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Gong, Chuqiao
Stephan, Ralf
May, Bruce
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Weiser, Joel
Beavers, Deidre
Conley, Patrick
Hermjakob, Henning
Stein
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Lincoln
D.
DEustachio, Peter
Wu, Guanming
DB Label
Database : Science Citation Index Expanded
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Open Access (OUP)
등재 - Web of Science
등재 - SCOPUS
조회 - Impact Factor (JCR)
7
Landscape of somatic single nucleotide variants and indels in colorectal cancer and impact on survival.
학술저널
issue
Nature communications
. 11(1)
Author
Zaidi, Syed H
Harrison, Tabitha A
Phipps, Amanda I
Steinfelder, Robert
Trinh, Quang M
Qu, Conghui
Banbury, Barbara L
Georgeson, Peter
Grasso, Catherine S
Giannakis, Marios
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Amitay, Efrat L
Barfield, Richard T
Berndt, Sonja I
Borozan, Ivan
Brenner, Hermann
Brezina, Stefanie
Buchanan, Daniel D
Cao, Yin
Chan, Andrew T
Chang-Claude, Jenny
Connolly, Charles M
Drew, David A
Farris, Alton Brad
Figueiredo, Jane C
French, Amy J
Fuchs, Charles S
Garraway, Levi A
Gruber, Steve
Guinter, Mark A
Hamilton, Stanley R
Harlid, Sophia
Heisler, Lawrence E
Hidaka, Akihisa
Hopper, John L
Huang, Wen-Yi
Huyghe, Jeroen R
Jenkins, Mark A
Krzyzanowski, Paul M
Lemire, Mathieu
Lin, Yi
Luo, Xuemei
Mardis, Elaine R
McPherson, John D
Miller, Jessica K
Moreno, Victor
Mu, Xinmeng Jasmine
Nishihara, Reiko
Papadopoulos, Nickolas
Pasternack, Danielle
Quist, Michael J
Rafikova, Adilya
Reid, Emma EG
Shinbrot, Eve
Shirts, Brian H
Stein
,
Lincoln
D
Teney, Cherie D
Timms, Lee
Um, Caroline Y
Van Guelpen, Bethany
Van Tassel, Megan
Wang, Xiaolong
Wheeler, David A
Yung, Christina K
Hsu, Li
Ogino, Shuji
Gsur, Andrea
Newcomb, Polly A
Gallinger, Steven
Hoffmeister, Michael
Campbell, Peter T
Thibodeau, Stephen N
Sun, Wei
Hudson, Thomas J
Peters, Ulrike
DB Label
Database : eScholarship
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Open Access (eScholarship)
8
Failure of human rhombic lip differentiation underlies medulloblastoma formation
학술저널
issue
Nature: International weekly journal of science
. 609(7929):1021-1028
Author
Hendrikse, Liam D.
Aff1, Aff2, Aff3
Haldipur, Parthiv
Saulnier, Olivier
Aff1, Aff2
Millman, Jake
Sjoboen, Alexandria H.
Erickson, Anders W.
Aff1, Aff2, Aff5
Ong, Winnie
Aff1, Aff2, Aff5
Gordon, Victor
Coudière-Morrison, Ludivine
Mercier, Audrey L.
Shokouhian, Mohammad
Suárez, Raúl A.
Aff1, Aff2
Ly, Michelle
Aff1, Aff2, Aff5
Borlase, Stephanie
Scott, David S.
Aff1, Aff2
Vladoiu, Maria C.
Aff1, Aff2, Aff5
Farooq, Hamza
Aff1, Aff2, Aff5
Sirbu, Olga
Aff1, Aff2, Aff3
Nakashima, Takuma
Nambu, Shohei
Funakoshi, Yusuke
Bahcheli, Alec
Aff10, Aff11
Diaz-Mejia, J. Javier
Golser, Joseph
Bach, Kathleen
Phuong-Bao, Tram
Skowron, Patryk
Aff1, Aff2, Aff5
Wang, Evan Y.
Aff1, Aff2, Aff3
Kumar, Sachin A.
Aff1, Aff2, Aff5
Balin, Polina
Aff1, Aff2, Aff5
Visvanathan, Abhirami
Aff1, Aff2
Lee, John J. Y.
Aff1, Aff2, Aff5
Ayoub, Ramy
Chen, Xin
Aff1, Aff2
Chen, Xiaodi
Aff1, Aff2
Mungall, Karen L.
Luu, Betty
Aff1, Aff2
Bérubé, Pierre
Wang, Yu C.
Pfister, Stefan M.
Aff15, Aff16
Kim, Seung-Ki
Delattre, Olivier
Aff18, Aff19
Bourdeaut, Franck
Aff18, Aff19
Doz, François
Aff18, Aff20
Masliah-Planchon, Julien
Grajkowska, Wieslawa A.
Loukides, James
Dirks, Peter
Aff1, Aff2, Aff10, Aff23
Fèvre-Montange, Michelle
Aff24, Aff25
Jouvet, Anne
French, Pim J.
Kros, Johan M.
Zitterbart, Karel
Bailey, Swneke D.
Aff29, Aff30
Eberhart, Charles G.
Rao, Amulya A. N.
Giannini, Caterina
Olson, James M.
Garami, Miklós
Hauser, Peter
Phillips, Joanna J.
Aff36, Aff37
Ra, Young S.
de Torres, Carmen
Mora, Jaume
Li, Kay K. W.
Ng, Ho-Keung
Poon, Wai S.
Pollack, Ian F.
López-Aguilar, Enrique
Gillespie, G. Yancey
Van Meter, Timothy E.
Shofuda, Tomoko
Vibhakar, Rajeev
Thompson, Reid C.
Cooper, Michael K.
Rubin, Joshua B.
Kumabe, Toshihiro
Jung, Shin
Lach, Boleslaw
Aff53, Aff54
Iolascon, Achille
Aff55, Aff56
Ferrucci, Veronica
Aff55, Aff56
de Antonellis, Pasqualino
Aff55, Aff56
Zollo, Massimo
Aff55, Aff56
Cinalli, Giuseppe
Robinson, Shenandoah
Stearns, Duncan S.
Van Meir, Erwin G.
Porrati, Paola
Finocchiaro, Gaetano
Massimino, Maura
Carlotti, Carlos G.
Faria, Claudia C.
Aff63, Aff64
Roussel, Martine F.
Boop, Frederick
Chan, Jennifer A.
Aldinger, Kimberly A.
Aff4, Aff67
Razavi, Ferechte
Silvestri, Evelina
McLendon, Roger E.
Aff70, Aff71
Thompson, Eric M.
Ansari, Marc
Aff72, Aff73
Garre, Maria L.
Chico, Fernando
Eguía, Pilar
Pérezpeña, Mario
Morrissy, A. Sorana
Aff66, Aff77, Aff78
Cavalli, Florence M. G.
Aff79, Aff80, Aff81
Wu, Xiaochong
Aff1, Aff2
Daniels, Craig
Aff1, Aff2
Rich, Jeremy N.
Jones, Steven J. M.
Aff13, Aff83, Aff84
Moore, Richard A.
Marra, Marco A.
Aff13, Aff83
Huang, Xi
Aff1, Aff2, Aff10
Reimand, Jüri
Aff3, Aff10, Aff11
Sorensen, Poul H.
Aff85, Aff86
Wechsler-Reya, Robert J.
Weiss, William A.
Aff36, Aff88, Aff89
Pugh, Trevor J.
Aff3, Aff11, Aff12
Garzia, Livia
Kleinman, Claudia L.
Aff91, Aff92
Stein
,
Lincoln
D.
Aff10, Aff93
Jabado, Nada
Aff94, Aff95
Malkin, David
Aff3, Aff96
Ayrault, Olivier
Golden, Jeffrey A.
Ellison, David W.
Doble, Brad
Ramaswamy, Vijay
Aff1, Aff2, Aff3, Aff96
Werbowetski-Ogilvie, Tamra E.
Aff6, Aff99
Suzuki, Hiromichi
Millen, Kathleen J.
Taylor, Michael D.
Aff1, Aff2, Aff3, Aff5, Aff23, IDs4158602205215w_cor133
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9
Pan-cancer analysis of whole genomes
학술저널
issue
Nature
. 578(7793)
Author
Campbell, Peter J
Getz, Gad
Korbel, Jan O
Stuart, Joshua M
Jennings, Jennifer L
Stein
,
Lincoln
D
Perry, Marc D
Nahal-Bose, Hardeep K
Ouellette, BF Francis
Li, Constance H
Rheinbay, Esther
Nielsen, G Petur
Sgroi, Dennis C
Wu, Chin-Lee
Faquin, William C
Deshpande, Vikram
Boutros, Paul C
Lazar, Alexander J
Hoadley, Katherine A
Louis, David N
Dursi, L Jonathan
Yung, Christina K
Bailey, Matthew H
Saksena, Gordon
Raine, Keiran M
Buchhalter, Ivo
Kleinheinz, Kortine
Schlesner, Matthias
Zhang, Junjun
Wang, Wenyi
Wheeler, David A
Ding, Li
Simpson, Jared T
O'Connor, Brian D
Yakneen, Sergei
Ellrott, Kyle
Miyoshi, Naoki
Butler, Adam P
Royo, Romina
Shorser, Solomon I
Vazquez, Miguel
Rausch, Tobias
Tiao, Grace
Waszak, Sebastian M
Rodriguez-Martin, Bernardo
Shringarpure, Suyash
Wu, Dai-Ying
Demidov, German M
Delaneau, Olivier
Hayashi, Shuto
Imoto, Seiya
Habermann, Nina
Segre, Ayellet V
Garrison, Erik
Cafferkey, Andy
Alvarez, Eva G
Maria Heredia-Genestar, Jose
Muyas, Francesc
Drechsel, Oliver
Bruzos, Alicia L
Temes, Javier
Zamora, Jorge
Baez-Ortega, Adrian
Kim, Hyung-Lae
Mashl, R Jay
Ye, Kai
DiBiase, Anthony
Huang, Kuan-lin
Letunic, Ivica
McLellan, Michael D
Newhouse, Steven J
Shmaya, Tal
Kumar, Sushant
Wedge, David C
Wright, Mark H
Yellapantula, Venkata D
Gerstein, Mark
Khurana, Ekta
Marques-Bonet, Tomas
Navarro, Arcadi
Bustamante, Carlos D
Siebert, Reiner
Nakagawa, Hidewaki
Easton, Douglas F
Ossowski, Stephan
Tubio, Jose MC
De La Vega, Francisco M
Estivill, Xavier
Yuen, Denis
Mihaiescu, George L
Omberg, Larsson
Ferretti, Vincent
Sabarinathan, Radhakrishnan
Pich, Oriol
Gonzalez-Perez, Abel
Weiner, Amaro Taylor
Fittall, Matthew W
Demeulemeester, Jonas
Tarabichi, Maxime
Roberts, Nicola D
DB Label
Database : eScholarship
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Open Access (eScholarship)
10
Analyses of non-coding somatic drivers in 2,658 cancer whole genomes.
학술저널
issue
Nature
. 578(7793)
Author
Rheinbay, Esther
Nielsen, Morten Muhlig
Abascal, Federico
Wala, Jeremiah A
Shapira, Ofer
Tiao, Grace
Hornshøj, Henrik
Hess, Julian M
Juul, Randi Istrup
Lin, Ziao
Feuerbach, Lars
Sabarinathan, Radhakrishnan
Madsen, Tobias
Kim, Jaegil
Mularoni, Loris
Shuai, Shimin
Lanzós, Andrés
Herrmann, Carl
Maruvka, Yosef E
Shen, Ciyue
Amin, Samirkumar B
Bandopadhayay, Pratiti
Bertl, Johanna
Boroevich, Keith A
Busanovich, John
Carlevaro-Fita, Joana
Chakravarty, Dimple
Chan, Calvin Wing Yiu
Craft, David
Dhingra, Priyanka
Diamanti, Klev
Fonseca, Nuno A
Gonzalez-Perez, Abel
Guo, Qianyun
Hamilton, Mark P
Haradhvala, Nicholas J
Hong, Chen
Isaev, Keren
Johnson, Todd A
Juul, Malene
Kahles, Andre
Kahraman, Abdullah
Kim, Youngwook
Komorowski, Jan
Kumar, Kiran
Kumar, Sushant
Lee, Donghoon
Lehmann, Kjong-Van
Li, Yilong
Liu, Eric Minwei
Lochovsky, Lucas
Park, Keunchil
Pich, Oriol
Roberts, Nicola D
Saksena, Gordon
Schumacher, Steven E
Sidiropoulos, Nikos
Sieverling, Lina
Sinnott-Armstrong, Nasa
Stewart, Chip
Tamborero, David
Tubio, Jose MC
Umer, Husen M
Uusküla-Reimand, Liis
Wadelius, Claes
Wadi, Lina
Yao, Xiaotong
Zhang, Cheng-Zhong
Zhang, Jing
Haber, James E
Hobolth, Asger
Imielinski, Marcin
Kellis, Manolis
Lawrence, Michael S
von Mering, Christian
Nakagawa, Hidewaki
Raphael, Benjamin J
Rubin, Mark A
Sander, Chris
Stein
,
Lincoln
D
Stuart, Joshua M
Tsunoda, Tatsuhiko
Wheeler, David A
Johnson, Rory
Reimand, Jüri
Gerstein, Mark
Khurana, Ekta
Campbell, Peter J
López-Bigas, Núria
PCAWG Drivers and Functional Interpretation Working Group
PCAWG Structural Variation Working Group
Weischenfeldt, Joachim
Beroukhim, Rameen
Martincorena, Iñigo
Pedersen, Jakob Skou
Getz, Gad
PCAWG Consortium
DB Label
Database : eScholarship
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